キルギスは、主に山によって国土が各地域によって分かれており、地域によって地形や気候の差が明白です。そのため、各地域の特産物も特色あるものとなっています。例えば首都ビシュケク周辺のチュイ州は、砂糖の原料となる甜菜の栽培で知られています。キルギス東部のイシククル州はリンゴやナシなどの果物が有名で、南部のバトケン州は乾燥アンズが盛んに作られています。同じく南部のオシュ州やジャララバード州はクルミと綿の一大生産地で、山の多いナリン州では畜産が盛んです。西部のタラス州では豆類が多く栽培されています。
キルギスの主要作物の一つであるジャガイモは、主にナリン州で生産され、カザフスタンへ輸出されています。
また、アメリカ合衆国国際開発庁（USAID）やドイツ国際協力公社（GIZ）などの協力で、キルギス国内の約1000の農家で輸出用作物の有機栽培に取り組んでいます。